Zadnje štiri epizode Vojne klonov se odvijajo hkrati z Maščevanjem Sitha, zadnjim filmom predzgodbe trilogije Vojne zvezd. To vključuje ukaz 66 in padec reda jedijev.
Neznan vidik Vojne zvezd je bil, kako je ljubljenka oboževalcev Ahsoka Tano preživela ukaz 66. Zadnji dve epizodi serije prikazujeta, kako je Ahsoka pobegnila.
Razdrobljen
V deveti in deseti epizodi sezone je Darth Maul nastavil past, da bi ubil Anakina Skywalkerja, preden bi ga Darth Sidious obrnil na temno stran. Vendar je bil Anakin zaposlen z reševanjem kanclerja Palpatina pred generalom Grievousom, kot je prikazano v začetni sekvenci Maščevanja Sitha. Tako se je Ahsoka namesto tega soočila z Maulom. Deseta epizoda se konča z Maulovim ujetjem.
Voditelj serije Dave Filoni je za Entertainment Weekly povedal: "Nekaj, kar sem si že dolgo želel narediti, je, da bi bil konec Vojne klonov ta sovpadajoča zgodba, v kateri so nekateri od teh ljudi, ki niso bili v filmi so. Ker mislim, da je samo to upravičeno vprašanje: Kje so bili ti fantje? Ahsoka se je zdela pomembna, zato je bila povabljena, da se pridruži Sithom? Kje je bil Rex? Zdelo se mi je, da potrebuje odgovor, ker so bili, po toliko epizodah in zgodbah očitno tako velik del življenja Anakina in Obi-Wana."
V enajsti epizodi z naslovom "Shattered", Ahsoka poskuša pripeljati Maula na Coruscant s poveljnikom klonov po imenu Rex in bataljonom vojakov klonov. Pojavi se več povezav do Revenge of the Sith. Poustvarjen je prizor iz filma; v prizoru Mace Windu in Yoda razpravljata o Palpatinu in njegovi odstranitvi s položaja po porazu generala Grievousa z drugimi člani sveta Jedijev. Prizor je razširjen z naslednjo razpravo z Ahsoko.
Medtem ko še potujeta po vesolju, Ahsoka in Maul začutita padec Ahsokinega nekdanjega gospodarja. Dejanski posnetek dialoga iz Revenge of the Sith s Haydenom Christensenom, Samuelom L. Jacksonom in Ianom McDiarmidom kot njihovimi liki, ki igrajo na prizorišču.
Po Anakinu na vrsti Sidious aktivira ukaz 66. Inhibitorski čipi so bili nameščeni v vsakega klonskega vojaka. Ko je razglašen ukaz 66, so prisiljeni ubiti vsakega Jedija proti lastni volji. Ko je ukaz izdan, Rex in njegovi kloni napadejo Ahsoko.
Zmaga in smrt
Ko je Rexu povrnjena svobodna volja, poskušata pobegniti republiški križarki v finalu serije z naslovom "Zmaga in smrt". To še dodatno zaplete Maul, ki uniči ladijski hiperpogon. Zaradi tega je križarka precej neuporabna, saj jo vleče gravitacija lune.
Medtem ko se križarka dvigne proti površini lune, Maul pobegne z uporabo raketoplana, verjetno na Zunanji rob, kjer postane znan kot Crimson Dawn, kot ga vidimo v Solo: Zgodba iz Vojne zvezd.
Rex in Ahsoka uporabita Y-Wing, da varno pristaneta na površini lune, ko se križarka zruši in ubije vse klone na krovu. Oba pokopljeta svoje padle tovariše in Ahsoka pusti svoj svetlobni meč na grobu.
Epizoda se konča z bataljonom jurišnikov, ki pregledujejo mesto strmoglavljenja, ki je zdaj prekrito s snegom. Darth Vader je z njimi. Vader najde Ahsokin svetlobni meč; tistega, ki ji ga je podaril v "Old Friends Not Forgotten, " deveti epizodi zadnje sezone.
Filoni je za ABC News povedal: "Upam, da bodo oboževalci odšli z ene ravni zelo zadovoljni in upam, da bodo odšli z večjim razumevanjem, zlasti o Jedijih in sili ter kaj vse to pomeni v tej zgodbi. V resnici gre za znakov na koncu."
Po Vojni klonov
Ahsokina zgodba se nadaljuje po seriji. Roman Ahsoka, ki ga je napisal E. K. Johnston spremlja Ahsokino potovanje eno leto po ukazu 66 in pripoveduje, kako je srečala Baila Organa, Leiinega posvojenega očeta, in se pridružila uporu.
Ahsoka se pojavi v prvih dveh sezonah Vojne zvezd Uporniki, ki se dogaja 14 let po Vojni klonov kot uporniški agent. V drugi sezoni Ahsoka odkrije resnico, da je njen nekdanji gospodar Anakin Skywalker Darth Vader. Oba se spopadeta in Ahsokina usoda je ostala dvoumna. Vendar pa je bilo v četrti sezoni razkrito, da je Ahsoko rešil Ezra, glavni lik serije. Ahsoka bo dočakala konec imperija.
Ahsoka je igrala kamejo v filmu The Rise of Skywalker in govori se, da se bo pojavila v drugi sezoni Mandalorianca.